指将两个或者两个以上的职能相近、联系紧密的机构整合设立为一个机构的行为。合并设立也称整合设立，合并设立后的机构，只能配一套领导班子、内设一套工作机构，计算一个机构数额。
合并设立的主要目的，是减少职责交叉分散重复，避免不同机构之间的推诿扯皮，通过机构优化重组设置，充分发挥资源的最大效益。